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Einführung in die angewandte Bioinformatik
Dies sind die Seiten zur Vorlesung Einführung in die angewandte Bioinformatik, die an der TU Dortmund im Sommersemester 2010 von Prof. Dr. Sven Rahmann gehalten wurde.
Klausur
23. Juli 2010 Alle, die die Klausur am 22.07.2010 mitgeschrieben haben, haben bestanden. Die Klausureinsicht findet statt: Do 29.07. 09:00-10:00 Uhr in OH14, Raum 203 (2. Stock). Um eine Voranmeldung an Sven Rahmann wird gebeten.
Anders als in den vorangegangenen Jahren gibt es in diesem Semester keine zweite Klausur. Der zweite Klausurtermin ist laut Prüfungsordnung der chemischen Biologie erst für das Ende des WiSe 2010/11 vorgesehen (Februar/März 2011).
Vorlesung
Die Vorlesung richtet sich an Studierende der chemischen Biologie im sechsten Semester. Der Dozent ist Prof. Dr. Sven Rahmann, die Übungsgruppen werden betreut von Dipl.-Inform. Marcel Martin.
Die Vorlesung findet donnerstags von 12:15–14:00 Uhr in HS 3 (Gebäude Chemie) statt.
Folien
- 15.04.2010 Einführung, KA/KS-Analyse, Shell-Befehle
- 22.04.2010 Shell-Befehle, Datenbanken, Publizieren
- 13.05.2010 Himmelfahrt
- 20.05.2010 Datenanalyse mit der Shell und R
- 27.05.2010 Proteindatenbanken
- 03.06.2010 Fronleichnam
- 10.06.2010 Sequenzähnlichkeit, Alignments, BLAST
- 24.06.2010 Phylogenetik und Taxonomie
- 01.07.2010 Fortsetzung Phylogenetik, RNA- und Proteinstruktur
- 08.07.2010 Fortsetzung Proteinstruktur, DNA Microarrays
- 15.07.2010 Fortsetzung Microarrays, Netzwerke
- 22.07.2010 Fragen zur Klausur. Nachmittags in der Übungsgruppe: Klausur!
Übungen
Alle Übungen finden donnerstags nach der Vorlesung in der Otto-Hahn-Str. 14, Raum U04 statt.
- Übungsblatt 1 (22.04.2010); dazu NC001143.fasta
- Übungsblatt 2 (29.04.2010)
- Übungsblatt 3 (06.05.2010)
- Übungsblatt 4 (20.05.2010); dazu klausur.dat
- Übungsblatt 5 (27.05.2010)
- Übungsblatt 7 (17.06.2010); dazu six_proteins.fasta
- Übungsblatt 9 (01.07.2010)