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Advanced Data Structures (and Algorithms)
20.3.2020: Das Seminar wird zunächst wie geplant (online) weiterlaufen. Je nach Lage bei Semesterende wird das Format der Vorträge evtl. auf Videovorträge umgestellt.
Inhalt
Wir wollen uns mit fortgeschrittenen Datenstrukturen für grundlegende Probleme beschäftigen, z.B. Suchen, Hashing, Datenstrukturen für Arrays, Bäume und Graphen, Succinct Data Structures, External Memory Data Structures. Auch fortgeschrittene Algorithmen wie die parallele Konstruktion von Datenstrukturen und parallels Sortieren werden behandelt.
Allgemeine Hinweise
Bitte beachten Sie neben den in der Vorbesprechung bekanntgegebenen Informationen auch dieses Informationsblatt.
Themenliste
Parallele Algorithmen
- (1) Omar Obeya, Endrias Kahssay, Edward Fan, Julian Shun: Theoretically-Efficient and Practical Parallel In-Place Radix Sorting. SPAA 2019: 213-224
- (2) Yan Gu, Julian Shun, Yihan Sun, Guy E. Blelloch: A Top-Down Parallel Semisort. SPAA 2015: 24-34
- (3) Uwe Baier, Timo Beller, Enno Ohlebusch: Space-Efficient Parallel Construction of Succinct Representations of Suffix Tree Topologies. ACM Journal of Experimental Algorithmics 22 (2017)
- (4) Timo Bingmann, Peter Sanders, Matthias Schimek: Communication-Efficient String Sorting. CoRR abs/2001.08516 (2020)
Texte
- (5) Johannes Bader, Simon Gog, Matthias Petri: Practical Variable Length Gap Pattern Matching. SEA 2016: 1-16
- (6) Vincent Cohen-Addad, Laurent Feuilloley, Tatiana Starikovskaya: Lower bounds for text indexing with mismatches and differences. SODA 2019: 1146-1164 (Thomas Buse)
- (7) Dominik Kempa, Tomasz Kociumaka: String synchronizing sets: sublinear-time BWT construction and optimal LCE data structure. STOC 2019: 756-767
- (8) Travis Gagie, Gonzalo Navarro, Nicola Prezza: Optimal-Time Text Indexing in BWT-runs Bounded Space. SODA 2018: 1459-1477
- (9) Giulia Bernardini, Huiping Chen, Gabriele Fici, Grigorios Loukides and Solon P. Pissis: Reverse-Safe Data Structures for Text Indexing. ALENEX 2020: 199-213 (Mustafa Yalciner)
- (10) Philip Bille, Inge Li Gørtz, Teresa Anna Steiner: String Indexing with Compressed Patterns. CoRR abs/1909.11930 (2019)
Space Efficient Data Structures
- (11) Pooya Davoodi, Rajeev Raman, Srinivasa Rao Satti: On Succinct Representations of Binary Trees. Mathematics in Computer Science 11(2): 177-189 (2017) (Christoph Stockhoff)
- (12) Andreas Poyias, Simon J. Puglisi, Rajeev Raman: Compact Dynamic Rewritable (CDRW) Arrays. ALENEX 2017: 109-119 (Jan Meinhövel)
- (13) José Fuentes Sepúlveda, Gonzalo Navarro, Diego Seco: Implementing the Topological Model Succinctly. SPIRE 2019: 499-512
- (14) Michal Ganczorz: Using statistical encoding to achieve tree succinctness never seen before. CoRR abs/1807.06359 (2018)
- (15) Tim Baumann, Torben Hagerup: Rank-Select Indices Without Tears. WADS 2019: 85-98 (Jan-Philipp Tarnowski)
- (16) Emmanuel Esposito, Thomas Mueller Graf, Sebastiano Vigna: RecSplit: Minimal Perfect Hashing via Recursive Splitting. arXiv:1910.06416v2. To appear in: ALENEX 2020 (Alexander Herlez)
- (17) J. Ian Munro, Bryce Sandlund, Corwin Sinnamon: Space-Efficient Data Structures for Lattices. arXiv:1902.05166 (Benedict Schubert)
Graphen und Sonstiges
- (18) Mihai Patrascu, Liam Roditty: Distance Oracles beyond the Thorup-Zwick Bound. SIAM J. Comput. 43(1): 300-311 (2014)
- (19) Timothy M. Chan, Mihai Patrascu: Counting Inversions, Offline Orthogonal Range Counting, and Related Problems. SODA 2010: 161-173
- (20) Naila Rahman, Richard Cole, Rajeev Raman: Optimised Predecessor Data Structures for Internal Memory. Algorithm Engineering 2001: 67-78 (Timm Grote)
- (21) Mihai Patrascu, Mikkel Thorup: Time-space trade-offs for predecessor search. STOC 2006: 232-240
- (22) Gerth Stølting Brodal, Pooya Davoodi, Moshe Lewenstein, Rajeev Raman, Srinivasa Rao Satti: Two dimensional range minimum queries and Fibonacci lattices. Theor. Comput. Sci. 638: 33-43 (2016) (Maximilian Freese)
Zeitlicher Ablauf
- Die Vorbesprechung fand am 31.1.2020 um 14:00 statt
- 07.02.2020: Doodle zur Themenvergabe schließt
- 20.4.2020: Einreichung der Kurzzusammenfassungen (“abstracts”)
- 25.5.2020: Einreichung der Ausarbeitungen (“submission deadline”). Bitte beachten Sie auch unsere Hinweise zur Rechtschreibung etc.
- 22.6.2020: Deadline für die Gutachten
- 29.6.2020: Deadline für die Einreichung der finalen Ausarbeitungen
- 14.-16.7.2020, jeweils 9:15-16:00: Seminarvorträge
Alle Deadlines jeweils abends um 18:00.
Einreichung der Artikel
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Voraussetzungen
Sie sollten Spaß an algorithmischen Problem und der Analyse von Algorithmen haben. Die Vorlesung DAP2 sollte nicht zu Ihren schlechtesten Fächern gehört haben. Im Idealfall haben Sie bereits andere Veranstaltungen aus diesem Bereich gehört (Algorithmen und Datenstrukturen, Effiziente Algorithmen, Algorithm Engineering, Algorithmische Bioinformatik, Text-Indexierung etc.) bzw. haben vor, dies noch zu tun.
Das Seminar ist geeignet für Informatiker im Master- oder Diplomstudiengang (Hauptstudium). Sie eignet sich gut als Vorbereitung zur Erstellung von Studien- oder Abschlussarbeiten (Master/Diplom) in der Arbeitsgruppe von Johannes Fischer.
Ort und Zeit
Das Seminar findet als Blockveranstaltung statt. Termine, auch zur obligatorischen Vorbesprechung, s. unter “zeitlicher Ablauf”.