Advanced Data Structures

Inhalt

Wir wollen uns mit fortgeschrittenen Datenstrukturen für grundlegende Probleme beschäftigen, z.B. Suchen, Hashing, Datenstrukturen für Arrays, Bäume und Graphen, Succinct Data Structures, External Memory Data Structures.

Allgemeine Hinweise

Bitte beachten Sie neben den in der Vorbesprechung bekanntgegebenen Informationen auch dieses Informationsblatt.

Themenliste

Allgemein

  • Arne Andersson. Balanced search trees made simple. In Proc. WADS, volume 709 of LNCS, pages 60–71, 1993.
  • Michael Mitzenmacher, Salvatore Pontarelli, and Pedro Reviriego. Adaptive cuckoo filters. In Proc. ALENEX, pages 36–47, 2018.
  • Bernard Chazelle, Joe Kilian, Ronitt Rubinfeld, and Ayellet Tal. The Bloomier filter: an efficient data structure for static support lookup tables. In Proc. SODA, pages 30–39, 2004.
  • Michael A. Bender, Martin Farach-Colton, Mayank Goswami, Rob Johnson, Samuel McCauley, Shikha Singh: Bloom Filters, Adaptivity, and the Dictionary Problem. CoRR abs/1711.01616, 2017.

Erweiterte Rechenmodelle

  • Michael A. Bender, Erik D. Demaine, and Martin Farach-Colton. Cache-oblivious B-trees. SIAM J. Comput., 35(2):341–358, 2005.
  • Klaus Brengel, Andreas Crauser, Paolo Ferragina, and Ulrich Meyer. An experimental study of priority queues in external memory. ACM Journal of Experimental Algorithmics, 5:17, 2000.
  • Julian Labeit, Julian Shun, Guy E. Blelloch: Parallel lightweight wavelet tree, suffix array and FM-index construction. J. Discrete Algorithms 43: 2-17, 2017.

Succinct Data Structures

  • Philip Bille, Anders Roy Christiansen, Nicola Prezza, and Frederik Rye Skjoldjensen. Succinct partial sums and Fenwick trees. In Proc. SPIRE, volume 10508 of LNCS, pages 91–96, 2017.
  • Patrick Klitzke and Patrick K. Nicholson. A general framework for dynamic succinct and compressed data structures. In Proc. ALENEX, pages 160– 173, 2016.
  • Stephane Durocher, Meng He, J. Ian Munro, Patrick K. Nicholson, and Matthew Skala. Range majority in constant time and linear space. Inf. Comput., 222:169–179, 2013.
  • Amr Elmasry, Daniel Dahl Juhl, Jyrki Katajainen, and Srinivasa Rao Satti. Selection from read-only memory with limited workspace. Theor. Comput. Sci., 554:64–73, 2014.

Strings

  • Robert W. Irving and Lorna Love. The suffix binary search tree and suffix AVL tree. J. Discrete Algorithms, 1(5-6):387–408, 2003.
  • Yoshimasa Takabatake, Yasuo Tabei, and Hiroshi Sakamoto. Online pattern matching for string edit distance with moves. In Proc. SPIRE, volume 8799 of LNCS, pages 203–214, 2014.
  • Djamal Belazzougui, Patrick Hagge Cording, Simon J. Puglisi, and Yasuo Tabei. Access, rank, and select in grammar-compressed strings. In Proc. ESA, volume 9294 of LNCS, pages 142–154, 2015.
  • Tomohiro I. Longest common extensions with recompression. In Proc. CPM, volume 78 of LIPIcs, pages 18:1–18:15, 2017.
  • Nicola Prezza. In-place sparse suffix sorting. In Proc. SODA, pages 1496–1508, 2018.
  • Pawel Gawrychowski, Adam Karczmarz, Tomasz Kociumaka, Jakub Lacki, and Piotr Sankowski. Optimal dynamic strings. In Proc. SODA, pages 1509–1528, 2018.
  • Travis Gagie, Giovanni Manzini, and Jouni Sirén: Wheeler graphs: A framework for BWT-based data structures. Theor. Comput. Sci. 698: 67-78, 2017.

Zuordnung

# Autoren Titel Teilnehmer/in Betreuer Termin
17. Bender et al.Bloom Filters, Adaptivity, and the Dictionary ProblemSimon Demming Fischer Mi 9
7. Brengel et al.An experimental study of priority queues in external memoryDanny Textores Fischer Mi 10
6. Labeit et al.Parallel lightweight wavelet tree, suffix array and FM-index constructionDaniel Sendzik Kurpicz Mi 11
21. Klitzke/NicholsonA general framework for dynamic succinct and compressed data structuresNico Bertram Kurpicz Mi 13
12. Durocher et al.Range majority in constant time and linear spaceJonas Ellert Fischer Mi 14
20. Gagie et al.Wheeler graphs: A framework for BWT-based data structuresTimo Walter Fischer Mi 15
10. Belazzougui et al.Access, rank, and select in grammar-compressed stringsJulian Sauer Köppl Do 9
15. I Longest common extensions with recompressionChristopher Osthues Köppl Do 10
5. Irving/LoveThe suffix binary search tree and suffix AVL treePhilipp Mewes Köppl Do 11

Zeitlicher Ablauf

  • 23.4.18: Doodle zur Themenvergabe schließt
  • 07.5.18: Einreichung der Kurzzusammenfassungen (“abstracts”).
  • 04.6.18: Einreichung der Ausarbeitungen (“submission deadline”)
  • 25.6.18: Deadline für die Gutachten
  • 09.7.18: Einreichung der finalen Ausarbeitungen
  • 18.7.-19.7.18: Seminarvorträge

Alle Deadlines jeweils abends um 18:00.

Einreichung der Artikel

Bitte reichen Sie Ihren Beitrag auf den Seiten von easychair ein (Account nötig). Benutzen Sie bitte diesen Latex-Style. Bitte tragen Sie bereits bei der Einreichung der Kurzzusammenfassung Ihre Matrikelnummer im Feld Web page ein.

Voraussetzungen

Sie sollten Spaß an algorithmischen Problem und der Analyse von Algorithmen haben. Die Vorlesung DAP2 sollte nicht zu Ihren schlechtesten Fächern gehört haben. Im Idealfall haben Sie bereits andere Veranstaltungen aus diesem Bereich gehört (Algorithmen und Datenstrukturen, Effiziente Algorithmen, Algorithm Engineering, Algorithmische Bioinformatik, Text-Indexierung etc.) bzw. haben vor, dies noch zu tun.

Das Seminar ist geeignet für Informatiker im Master- oder Diplomstudiengang (Hauptstudium). Sie eignet sich gut als Vorbereitung zur Erstellung von Studien- oder Abschlussarbeiten (Master/Diplom) in der Arbeitsgruppe von Johannes Fischer.

Ort und Zeit

Das Seminar findet als Blockveranstaltung vom 18.-19.7.2018 jeweils von 9 bis 16 Uhr (c.t) im Raum 3.030 statt.

Es findet eine Vorbesprechung in der OH14, Raum E04 statt, und zwar am 17.4.2018 um 17:15 Uhr statt.

 
Last modified: 2018-07-16 09:48 by Dominik Köppl
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