Algorithmische Bioinformatik (Spezial-/Vertiefungs-/Master-Vorlesung und Übung)

Wintersemester 2008/09

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Veranstalter: Sven Rahmann (vorname.nachname[at]uni-dortmund.de)
Voraussetzungen: Algorithmen und Datenstrukturen
Termin: Mo 10-12; Do 8-9; Übung Do 9-10
Raum: Mo OH14, 104; Do OH16, E07

Schwerpunktgebiete: 4 (Algorithmen und Komplexität), 6, 7
ECTS credits: 6 (V+Ü)

Mögliche Prüfungsleistungen (6 ECTS credits):

  • Leistungsnachweis (Schein), unbenotet; durch Besuch der Vorlesung und Bearbeiten der Übungsaufgaben zum Vorlesungsinhalt
  • mündliche Fachprüfung zum Vorlesungsinhalt (zur Vorbereitung wird die Bearbeitung der Übungsaufgaben sehr empfohlen)

Inhalte und Termine: im AlgoBio-Wiki (Anmeldung mit Passwort erforderlich!)

Kommentar:

Wir behandeln verschiedene Algorithmische Aspekte der Bioinformatik, allerdings ohne Probleme, die in der Spezialvorlesung "Algorithmen auf Sequenzen" behandelt werden. Es ist sinnvoll, bei Interesse beide Veranstaltungen zu besuchen.

Themenbeispiele sind:

  • Genomsequenzierung und -assemblierung
  • Signale in Sequenzen (Motivsuche)
  • Rekonstruktion Phylogenetischer Bäume
  • Genom-Dynamik (Umordnungsprobleme)
  • Genexpressions-Analyse
  • Regulatorische Netzwerke
  • Algorithmen der Massenspektrometrie
  • Analyse metabolischer Netzwerke
Diese Veranstaltung entspricht Master-Modul INF-MA-606, kann aber ggf. auch als INF-MA-603 angerechnet werden; bitte mit dem Veranstalter absprechen.

Die Vorlesung wird von praktischen und theoretischen Übungsaufgaben begleitet, deren Bearbeitung wichtig für ein richtiges Verständnis des Sotffes ist. Die Übungen finden am im selben Raum im unmittelbaren Anschluss an die Vorlesung statt.

Im Anschluss an diese Vorlesung besteht bei Begabung und Interesse die Möglichkeit, in diesem Bereich eine Diplomarbeit zu schreiben.

Stand: 31.07.2008 - Sven Rahmann