Seminar Aktuelle Themen der Bioinformatik: Effiziente Verarbeitung großer Datenmengen

Sommersemester 2008

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Veranstalter: Sven Rahmann (vorname.nachname[at]uni-dortmund.de)
Voraussetzungen: Grundkenntnisse der algorithmischen Bioinformatik
Teilnehmerzahl: maximal 10
Vorbesprechung: am ersten Termin, 14.04.2008, 14ct, in OH14, R203
Termin: Mo 14-16
Raum: OH14, R203 (kleiner Besprechungsraum)

NEU! Themen und Termine: hier

Anleitung zum Herunterladen der Materialien: Bitte in der Termindatei nachschauen, welche Nummer der eigene Vortrag hat. Die Materialien dazu kann man herunterladen, wenn man in den Browser /[nummer].pdf an die URL dieser Webseite hängt, also z.B. 17.pdf. Bei Problemen bitte eine email schicken.

Inhalt:

Wir besprechen in Form von Vorträgen und kritischen Diskussionen aktuelle Arbeiten aus dem Bereich der algorithmischen Bioinformatik, wie sie auch auf den gängigen Bioinformatik-Tagungen (z.B. ISMB, WABI, CSB, RECOMB, ISBRA, Integrative Bioinformatics) erscheinen könnten. Häufig, aber nicht ausschließlich liegen diese Arbeiten in den Bereichen

  • Stochastische Methoden
  • Kombinatorische Optimierung
  • Algorithmenentwurf- und Analyse (randomisierte Algorithmen, fixed-parameter Algorithmen, schnelle Heuristiken)

Im SoSe 2008 werden wir den Fokus auf die effiziente Verarbeitung großer Datenmengen aus dem Genom-, Proteom-, und Metabolombereich legen, und auch Verfahren zur Analyse von Licht- und Elektronen-Mikroskopiebildern beleuchten.

Es wird darum gebeten, bei Interesse vorab eine e-mail an den Veranstalter zu schreiben.

Stand: 15.04.2008 - Sven Rahmann